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在西林漫不经心的管理下，A站涌现出了大量内容生产者，产生了很多二次制作的视频，也让“鬼畜视频”文化流行起来。“金坷垃”、“元首的愤怒”、“德国骨科”、蓝翔挖掘机、鬼畜全明星、我的滑板鞋、小苹果等大量二度创作内容流行开来，在2010年，A站举办了第一届Acfun春晚，A站的人气达到了顶峰。

对于还在学校读书的西林，管理公司显然超出他的能力范围。最早期的A站全靠元老自发运营。从2009年起公司的管理问题越发凸显，无心经营的西林曾把A站交给三任站长代为经营，A站经常出现服务器出错，没人审核稿件的情况。从创立到2010年期间，A站一直没有封面，弹幕播放器也从未更新。

2009年6月，A站爆发员工内讧。7月，A站因为机器故障连续一个月无法访问。这两起事件让A站的老会员，刚从北邮毕业的徐逸（⑨bishi）看不下去，他花了三天，建立了一个叫mikufans的临时站点给大家先解解馋。后来mikufans留了下来，改了个名字，成为了Bilibili（下简称B站）。A站的懒散使它亲手培养了自己的对手。有网友回忆，2010年3月，A站上出现了大量贬低A站，呼吁用户去B站的弹幕，这使得A站损失了很多用户。弹幕事件也成了A站和B站恩怨的起点。

现在看来，2010年也成了A站的转折点。那一年，创始人西林在没经过其他人同意的情况下，索性以400万的价格，把A站卖给了陈少杰，实现了在长沙买房买车的梦想。从此，A站开始了漫长的宫斗之路，几年内数次易主，每一次融资都伴随着高层的震荡。

也正是在2010年，徐逸遇上了在猎豹移动做副总裁的陈睿，陈睿是猎豹移动的第三号员工，和搜狗CEO王小川是成都七中的同班同学。家境殷实的他是第一批接触二次元的中国网民。并且在猎豹上班的时候，就看了大量的动漫作品。2010年，他给B站投了一笔钱，虽然他第一眼看到B站的时候觉得“这是最不像能做成一个公司的东西”。此后他一直做B站的业务顾问，2014年猎豹移动IPO后，陈睿索性正式加入B站，成为合伙人，并担任董事长，此后，B站在陈睿的经营下，一步步走上了正轨。

而2010年的陈少杰接盘A站后，把重心都放在直播上，并孵化出斗鱼直播，但并未对社区经营下很大功夫。2014年年初，斗鱼创始人陈少杰将收购4年的A站转手卖给手游公司晶合思动的创始人杨鑫淼，并带走了斗鱼直播。同年，4月27日，时任A站站长的赛门离开A站。

2014年4月，奥飞娱乐入股A站，空降了一批新的管理层至A站，原先的站内管理员几乎悉数被解职或调任。

2015年8月，优酷土豆母公司合一集团以5000万元领投A站的A轮融资，占股18%。这次融资开始于一场官司。由于A站的视频资源很多来自于外链，通过非正规方式盗链了优酷土豆，构成了侵权。在版权纠纷中，优酷土豆对Acfun进行实名举报，司法机关还逮捕了A站3名高层人员，导致大批员工离职。融资是这次诉讼的解决方案。这次诉讼后，A站高层又一次变动，杨鑫淼的发小孙旻成了新的CEO，北电老师，做过几家动漫杂志的刘炎焱担任了总编辑。

在A站重新组建管理团队的时候，B站已经抢先一年接受了IDG的A轮融资，并且从2015年起，默默投资了“三文娱”、“那年那兔那些事儿”等近30家ACG创业公司。

2016年1月，A站获得软银中国A+轮6000万投资，管理层再度调整。这次，孙旻由CEO升级成为总裁，并任命莫然担任CEO。莫然之后又邀请来半次元的CEO王伟（ptw）担任管理产品技术主管，原先的领导层和中层再一次遭到清洗。

2016年7月，董事长兼CEO莫然辞职，原A站总编辑刘炎焱接任CEO。奥飞娱乐副总裁和首席战略官李斌接任董事长。

刘炎焱曾创立过几家动漫杂志，从加拿大留学后，便在北京电影学院任教，教授“视听语言”和“道教传统美学”据网友称，他的课很火，是北电最红的老师之一。他觉得，二次元是浪漫主义的，相信通过努力不光能改变自己的命运，世界也能改变。他喜欢A站的“氛围”场，“喜欢在豆瓣聊电影的人为什么不去新浪的评论下聊电影？因为豆瓣有这个聊的氛围，而A站也有这个氛围。”他对媒体表示，他加入A站的时候，正是A站从武汉迁到北京，领导层极不稳定的时候，很多人劝他不要去，但他仍毅然加入。“没辙，谁让自己中二呢？老想拯救世界，这事儿没救。”他说。